Sejarah Lahirnya Widyakarya Nasional Pangan dan Gizi IX berawal dan adanya instruktur Presiden pada tahun 1967 kepada Bappenas untuk menyusun rencana pembangunan ekonimi lima tahun yang kemudian dikenal dengan REPELITA I. Dalam Proses penyusunan REPELITA I ini Bappenas bersama bersama LIPI dan di bantu oleh pakar dari National Academy of Sciences, Amerika Serikat, mengadakan Workshop on food pada bulan Mei tahun 1968. Kegiatan ini merupakan forum ilmiah untuk membahas masalah pangan dan gizi dalam REPELITA I. Semejak itu Bappenas bersama LIPI, Departemen terkait, dan Organisasi profesi, menyelengarakan workshop kedua, ketiga, dan seterusnya secara rutin setiap 4-6 tahun sekali menjelang penyusunan REPELITA, yang kemudian dinamakan Widyakarya Nasional Pangan dan Gizi atau WNPG. Kegiatan WNPG terakhir atau ketujuh diselengarakan pada tahun 2000 yang secara khusus membahas dampak krisis ekonomi terhadap pangan dan gizi.